他还与刘邦采、刘文敏、刘子和等人创建复古、复真和连山诸书院，并作《重修学宫记》《创建复古书院记》《重修儒学记》以叙其事。他酷爱家乡的山山水水，对家乡的一草一木饱含深情，每当闲遐之时，他便游览县内的风景名胜，并多有唱咏。蚓《游武功上西石屋山》《集云庵》《谈道石》《游机心潭至龙潭》《同讷溪罗念庵刘三五游九峰》《石屋山》《游天台山》《马迹石》《过三峰》《归自武功至瀑水岩》等，为后人留下了许多清新瑰丽的诗作。

为了传播王学，邹守益还利用县内书院，为四乡会讲授阳明理学精髓，春秋两季则合五郡出青原为大会，郡邑乡大夫都前往参加。这是继惜阴会后，江西又一个闻名中国的学术盛会，来自江西乃至全国的王门弟子，在这里聚集一堂，探讨学问，在邹守益等人的努力下，青原山成为当时一个重要的学术中心。

邹守益任南京吏部考功郎中，次年为司经局洗马，充经笼宫，为皇帝讲解经传史鉴。不久，又改任太常少卿兼侍读学士，执掌南京审林院，这期间邹守益都是任文官，没多少实权，原因是他刚正不阿，敢言直谏，为朝廷所顾忌，所以敬而远之。在任南京国子监祭酒后，邹守益一上任就着手整顿学风，严格学校管理，激励学生专心向学，后又因犯颜直谏被贬滴归乡。

回到安福，邹守益更“以觉人垂后为己任”，每月的初一、十五召聚门生讲习于明伦堂，复古、复真等书院纷纷邀请他主讲。邹守益讲学言语明白简易，听者很受启悟，此时的“青原会“还在继续进行，邹守益成为青原会的主讲。然而王门弟子也并非人人都能遵守王守仁修己正身的那一套规矩，“精进者寡，因循者众，是忽实修而崇虚谈“。

为了扭转这种不良学风，保持过去“惜阴会“的传统，邹守益作《惜阴申约》，严厉批评参加讲会的部分会友的陋习，严格要求大家:“自今以往共决除旧布新之策，人置一簿用以自考，家立一会与家考之，乡立一会与乡考之。凡乡会之日……相与虚心稽切：居处果能恭否？执事果能敬否？与人果能忠否？尽此者为德业，悖此者为过失。德业则直书于策以示劝，过失则婉书于策以示戒。其人会者策书姓名，下注愿如约，其不愿者勿强其续，愿人者忽限时。“用以督促会友们的道德躬行。

为了叙述王守仁的生平、学术成就与学术传递，王守仁去世后，王门弟子合作编修《王文成公年谱》，守益被推为编修总裁。然而，没有等到《年谱》修成，便因病逝世，终年72岁。