申时行没想到朱常洛把话题一转，转到了军镇管理上去了。

这一下子就戳中了申时行的短板，申时行他可没有过地方主政经验，也没有过边镇管理经验。

猛然的面对朱常洛这一发问，申时行只能说道：“臣会和内阁商议出一个章程，然后着令兵部，都察院和五军都督府从严监督军镇事务，防止再有贪腐之徒，欺上瞒下，败坏卫所。”

朱常洛叹息一声，显然他不满意这个回答。

如果，只靠着兵部，都察院和五军都督府的监督就能把军镇给管理好，那么大明的卫所制也不至于被败坏到这般田地。

显然，原来的那一套行至今时，早就破败不堪，不能承担大用了。

但是，这些话朱常洛也不能跟申时行讲。

朱常洛说道：“这份议罪的章程就先放在孤这里，等孤奏明了父皇，待父皇圣裁以后，孤就下令内阁终结此案。”

申时行听到这话后，他不由的松了口气，这件事总算是快要结束了。

“殿下圣明。”

朱常洛听着申时行的这句圣明，他不由得笑了。

朱常洛道：“圣明不圣明，孤说了不算。但是这次蓟镇的事情和石星等人的罪过，让孤明白了一个道理。孤觉得靠着现行的都察院和六科给事中的职能，他们并不足以起到监察百官，纠正朝廷风气的作用。所以，孤决议新设廉政署和反贪署，此二署分别设置于内阁和都察院之下。内阁主管廉政署，司署长官暂由钟化民担任。都察院主管反贪署，司署长官由董其昌担任。申先生以为如何？”

申时行没想到朱常洛一张口就要设置出两个新衙门，这好像与朝廷制度不合。

但是，等到申时行抬头看到朱常洛的目光时，申时行立刻回道：“臣无异议。”

朱常洛微笑道：“好，那孤就把此事禀报父皇，两署的设置工作和品级职责就暂由内阁梳理。”

申时行回道：“臣遵旨。”

到了这个时机，朱常洛也终于开始把自己的手往朝廷事务中插了。

这次的蓟镇案虽然牵扯甚大，但也已经证明了朱常洛的控局能力，他虽然一直没有说过什么话，但是，申时行和内阁其他两位阁老都清楚，蓟镇案之所以能查到现在这个地步，其实都是朱常洛的授意。

所以，兵部和户部才会有三个三品侍郎落马。

现在的兵部已经彻底成了李成梁的一言堂，而李成梁想要继续坐稳兵部，他就只能拼死效忠朱常洛。

不然，以他的出身和这场牵连甚广的蓟镇案带来的反噬，李成梁是万万承受不住的。

所以，六部之一的兵部实际上是已经把朱常洛控在了手里。

而且，还有工部，现在的工部因为正和西山皇庄合作的缘故，沈思孝也是唯朱常洛马首是瞻，由此，六部之一的工部也在朱常洛手里了。

还有现在正要准备扩大的顺天府，其实也已经被朱常洛纳在了手中，朱常洛以直隶总督的名义，可以直接到顺天府发号施令，顺天府尹房守士为报朱常洛的知遇之恩，他对朱常洛也是亦步亦趋。

由此，一场蓟镇案下来，朱常洛在无形之中已经在毫无根基的朝堂中，占据到了万历皇帝努力了二十多年都未曾达到的高度。

从此案以后，朱常洛才算是名副其实的监国皇太子。不然，他也不能张嘴就要设立两个新衙门出来的。这都是实力的体现！